Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b1Q99NB9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms