Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf17Q99MV7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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