Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprtQ99M80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprtQ99M80 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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