Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ddb2Q99J79 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms