Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf144aQ925F3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnf144aQ925F3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms