Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b3Q921M3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms