Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Odf3Q920N1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Odf3Q920N1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Odf3Q920N1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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