Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med28Q920D3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms