Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smg8Q8VE18 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg8Q8VE18 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms