Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fyco1Q8VDC1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fyco1Q8VDC1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms