Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt25Q8VCW2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt25Q8VCW2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms