Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn4Q8VCH8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn4Q8VCH8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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