Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hecw1Q8K4P8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hecw1Q8K4P8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms