Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms