Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms