Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sde2Q8K1J5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sde2Q8K1J5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms