Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d5Q8JZW5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms