Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms