Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bcas3Q8CCN5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms