Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SynpoQ8CC35 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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