Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms