Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trerf1Q8BXJ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms