Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx17Q8BVL3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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