Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PgghgQ8BP56 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PgghgQ8BP56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms