Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup93Q8BJ71 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms