Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slfnl1Q8BHW9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slfnl1Q8BHW9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms