Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot10Q8BH15 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms