Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms