Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc50Q810U5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc50Q810U5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc50Q810U5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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