Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms