Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim19Q80ZU4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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