Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZT1

1700001K19Rik, MCG11474, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001K19RikQ80ZT1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700001K19RikQ80ZT1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms