Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn34b3Q80ZS5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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