Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc1Q80VQ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms