Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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