Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpp38Q80UU2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms