Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms