Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek5Q7TSC3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek5Q7TSC3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms