Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf18Q7TS55 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf18Q7TS55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms