Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN73

Casd1, N-acetylneuraminate 9-O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casd1Q7TN73 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casd1Q7TN73 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms