Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35Q6ZWV7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms