Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd3Q6ZQK0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms