Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf653Q6YND2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf653Q6YND2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms