Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms