Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms