Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms