Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl3Q6P1Y1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms