Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpdc1Q6NZK8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpdc1Q6NZK8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms