Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rcbtb1Q6NXM2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rcbtb1Q6NXM2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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