Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fndc3bQ6NWW9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms